| Administrations civiles | 1106-1792 | Série C | Rattachement à l’état des fonds des Archives | | Panier |
| Préfecture impériale de Haguenau (Landvogtey). | 1106-XVIIIe s. | C 1-102 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | recordgrp | Panier |
| L'origine de la Préfecture impériale de Haguenau, ses prises de possession et ses dégagements. | 1372-1566 | C 1-2 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Engagements et dégagements de la Préfecture impériale de Haguenau entre 1372 et 1558. Engagement de la préfecture de Haguenau entre les mains de l'électeur Louis le Barbu par les empereurs d'Allemagne Robert, Sigismond et Frédéric IV ; négociations pour indemnités entre l'empereur Maximilien et l'électeur Louis le Pacifique et prise de possession de la préfecture par la maison d'Autriche ; nouvel engagement de la préfecture par le Roi des Romains Ferdina... | 1372-1558 | C 1 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Guerre, défense et sûreté publique. | 1373-1635 | C 3-9 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-fonds | Panier |
| Troubles dans le ressort de la Préfecture impériale de Haguenau aux XIVe, XVe et XVIe siècles. | 1373-1554 | C 3-4 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Paix castrales ; troubles en Alsace pendant la guerre entre Charles le Téméraire et René de Lorraine ; ligue dite "Bundschuh" ; mouvements en Alsace par suite de la mésintelligence entre l'empereur Maximilien Ier et l'électeur palatin Philippe ; guerre de Maximilien Ier et de la Ligue de Souabe contre les Suisses. | 1373-1525 | C 3 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Personnel de la Préfecture. | 1437-XVIIIe siècle | C 10-27 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-fonds | Panier |
| Nomination et rémunération des préfets (landvogts), sous-préfets (unterlandvogts) et employés de la Préfecture. | 1437-XVIIIe siècle | C 10-22 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Préfets et sous-préfets. | 1437-XVIIIe siècle | C 10-15 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-série organique | Panier |
| Nominations des préfets et sous-préfets. | 1437-1616 | C 10 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Nominations et installations des sous-préfets. | 1439-1631 | C 11-13 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Groupe de dossiers | Panier |
| Sous-préfets nommés entre 1439 et 1567. | 1439-1567 | C 11 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Dossier sur les comtes palatins, préfets, comme arbitres et engagistes. | 1465-1547 | C 14 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Le "Schultheissenamt", ou charge de Prévôt impérial à Haguenau. | 1472-1636 | C 16 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Receveurs généraux de la Préfecture. | 1471-1632 | C 18-19 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-série organique | Panier |
| Receveurs généraux nommés entre 1471 et 1557. | 1471-1557 | C 18 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Contrôleurs, procureurs, avocats et agents inférieurs, tels que sergents, valets et messagers. | 1481-1626 | C 21 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la Décapole. | 1340-XVIIIe siècle | C 28-49 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-fonds | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la ville de Haguenau. | 1374-1634 | C 28-34 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Privilèges accordés à la ville de Haguenau. | 1374-1630 | C 28 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Affaires civiles et criminelles de la ville de Haguenau. | 1481-1634 | C 29 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Litige entre la ville de Haguenau et la Préfecture impériale de Haguenau pour affaires de privilèges respectifs. | 1327-1578 | C 29bis-30 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-série organique | Panier |
| Projet d'accomodement entre l'archiduc d'Autriche, le préfet et les conseillers de la Préfecture impériale de Haguenau d'une part et la ville de Haguenau d'autre part. | 1327-1578 | C 29bis | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la ville de Landau. | 1340-1630 | C 35 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la ville de Wissembourg. | 1343-1632 | C 36-38 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Engagement de la ville de Wissembourg entre les mains de Robert, comte palatin du Rhin ; conflits de juridiction entre la ville de Wissembourg, l'abbaye de Wissembourg et les électeurs palatins ; sacrilège commis par le sieur de Linange ; tarif de grains établi par l'électeur palatin et contesté par la ville ; le Staffelgericht ou Tribunal abbatial ; nomination d'un sieur d'Andlau comme protecteur de Wissembourg ; péage d'Altenstadt. | 1343-1522 | C 36 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la ville de Rosheim. | 1481-1631 | C 40-41 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Charge de prévôt et sous-prévôt de Rosheim ; collonge de l'Evêque de Strasbourg à Rosheim et litige pour glandage avec le fermier de Gutenhausen ; affaires civiles et criminelles. | 1481-1626 | C 40 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la ville d'Obernai. | 1452-1653 | C 39 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la ville de Sélestat. | 1458-1632 | C 42 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la ville de Kaysersberg. | 1453-XVIIIe siècle | C 43 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la ville de Turckheim. | 1485-1632 | C 44 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la ville de Colmar. | 1371-1638 | C 45 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la ville de Munster. | 1466-1653 | C 46 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la ville de Mulhouse. | 1469-1655 | C 47-49 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Mémoire sur Mulhouse et sur la nature des fiefs d'Alsace, présenté par les officiers de l'archiduc Sigismond d'Autriche à Charles le Téméraire, duc de Bourgogne ; affaires d'impositions ; conflits de juridiction entre Mulhouse et les Régences d'Ensisheim et de Brisach, pour envahissement de ban, affaires forestières et de chasse. | 1469-1601 | C 47 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la préfecture avec les villages impériaux. | 1410-XVIIIe s. | C 50-53 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-fonds | Panier |
| Relations de la Préfecture avec les villages de Bischwiller, Bitschhoffen et de Dangolsheim. | 1480-1630 | C 52 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec les villages d'Erpach, Forstheim, Gunstett, Surbourg, Kuttolsheim, Mommenheim, Morschwiller-le-Bas, Ohlungen, Rottelsheim, Rumersheim, Schwabwiller, Uhlwiller et Wingersheim. | 1410-XVIIe s. | C 53 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec différentes familles nobles. | 1412-XVIIIe s. | C 55-61 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Relations de la Préfecture avec les comtes de Hanau-Lichtenberg. | 1466-1614 | C 55 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec les comtes de Deux-Ponts-Bitche. | 1471-1576 | C 56 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec les seigneuries et châteaux de Flexbourg, Hohenbourg, Langensoultzbach et La Petite-Pierre. | 1412-XVIIIe s. | C 57 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec les châteaux de Hattwiller, du Drachenfels et de Landstuhl. | 1437-XVIIIe s. | C 58 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec les comtes de Nassau et les familles de Mullenheim, Linange-Westerbourg, Fleckenstein, Ribeaupierre, Wilsperg, Hanau, Falckenstein et Lichtenberg. | 1447-XVIIIe s. | C 60 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec les seigneurs d'Allemagne, au-delà du Rhin et dans le Palatinat. | 1444-1638 | C 62 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec le magistrat de Strasbourg, avec l'hôpital de Strasbourg et avec la famille de Geroldseck. | 1410-1604 | C 63 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec les établissements religieux. | 1106-XVIIIe s. | C 64-73 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la Cour de Rome et avec l'évêché de Strasbourg. | 1347-1630 | C 64 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec les chapitres de Klingenmünster, de Notre-Dame de Landau, de Seltz, de Surbourg et de l'évêché de Spire. | 1369-1631 | C 66 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec l'abbaye et le chapitre de Wissembourg. | 1367-1628 | C 67-70 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-série organique | Panier |
| Relations de la Préfecture avec l'abbaye et le chapitre de Wissembourg entre 1490 et 1533. | 1490-1533 | C 68 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec l'abbaye et le chapitre de Wissembourg entre 1482 et 1628. | 1482-1628 | C 70 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec la cure de l'église Saint-Georges de Haguenau, la cure de l'hôpital de Haguenau, les couvents des Augustins, des Déchaussés, des Pénitentes et les couvents de Sainte-Marie et de Saint-Guillaume à Haguenau, les pères jésuites à Haguenau, l'abbaye de Schwarzach, l'abbaye de Sturzelbronn, l'abbaye de Sainte-Walpurge et la Chartreuse de Strasbourg. | 1106-XVIIIe s. | C 71 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Préfecture avec le chapitre de Saint-Martin et les églises de Colmar et avec l'abbaye de Munster. | 1473-1631 | C 73 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Affaires de police et affaires judiciaires. | 1474-1647 | C 74-77 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-fonds | Panier |
| Affaires criminelles et délits. | 1481-1630 | C 75-76 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Affaires criminelles et délits jugés entre 1486 et 1587. | 1486-1587 | C 75 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Affaires civiles. | 1474-1647 | C 77 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Les Juifs de la Préfecture. | 1448-1658 | C 78 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Dettes et capitaux affectés sur la Préfecture. | 1452-1629 | C 79 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Revenus de la préfecture et impositions. | 1422-1632 | C 81-85 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-fonds | Panier |
| Corvées à faire par les communautés de la Préfecture ; droit de sauf-conduit ; péage de Châtenois ; contributions et impositions ; droit d'hospitalité ; greniers à sel ; droits de succession ; droits d'Umgeld sur les vins ; prix et vente des grains. | 1466-1630 | C 81 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Confiscations de biens et amendes judiciaires ; subsides contre les Turcs ; rentes foncières de la Préfecture ; contribution extraordinaire pour les fortifications et les bâtiments ; exemption des droits de péage. | 1485-1631 | C 82 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Taille d'Empire payée par les villes de la Préfecture. | 1422-1632 | C 83-85 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Taille d'Empire payée par les villes de la Préfecture entre 1450 et 1583. | 1450-1583 | C 84 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Bâtiments publics. | 1476-1628 | C 86 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Affaires forestières. | 1349-1715 | C 87-89 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-fonds | Panier |
| Affaires de droit de chasse, droits d'usages forestiers, de nomination de forestiers et de délits forestiers. | 1349-1630 | C 87-88 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Affaires de droit de chasse, droits d'usages forestiers, de nomination de forestiers et de délits forestiers entre 1349 et 1573. | 1349-1573 | C 87 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Litiges et plaintes divers relatifs aux forêts de Haguenau et de Mellringen. | 1436-1715 | C 89 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Comptabilité de la Préfecture. | XVe s.-XVIIe s. | C 90-99 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-fonds | Panier |
| Quittances données aux receveurs de la Préfecture. | 1469-1555 | C 90 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Comptes des receveurs de la Préfecture. | 1406-1574 | C 91 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Reliquat de comptabilité et de quittances. | XVe s.-XVIIe s. | C 92 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Correspondance et comptes des receveurs Emmerich, Ritter, Imhof, Stemmler et Schmeltzer avec pièces justificatives. | 1479-1617 | C 93-96 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Comptabilité des receveurs de la Préfecture entre 1479 et 1555. | 1479-1555 | C 93 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Comptes de la seigneurie de Cleebourg et de Grafendahn. | 1458-1500 | C 97 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Comptes de Cleebourg, Châtenois, Barr et Haguenau. | XVe s.-XVIe s. | C 98 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Supplément aux comptes. | 1449-1622 | C 99 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Affaires litigieuses. | 1438-1624 | C 100 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Archives (titres anciens) de la Préfecture. | 1320-XVIIIe s. | C 101-102 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | | Panier |
| Recherche et enlèvement de titres concernant la Préfecture impériale de Haguenau et les bailliages de Germersheim et de Seltz ; pièces relatives à divers engagements consentis par les comtes palatins et les princes d'Autriche. | 1354-XVIIIe s. | C 101 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Inventaire du fonds de la Préfecture impériale de Haguenau, ou répertoire sommaire des documents recueillis dans les archives d'Innsbruck, et concernant l'Alsace ainsi que le Sundgau, daté de 1763 ; pièces supplémentaires n'ayant pas trouvé leur place dans les autres parties du fonds de la Préfecture. | 1320-1763 | C 102 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Pièce (registre) | Panier |
| Régence autrichienne d' Ensisheim. | 1440-XVIIIe s. | C 103-133 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | recordgrp | Panier |
| Contestations de la Régence d'Ensisheim avec les familles de Neuenstein, Rüst, Sickingen, Wattwil, Wilsperg, Reinach et Wahlenheim. | 1449-1657 | C 118 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Relations de la Régence d'Ensisheim avec les abbayes de Gengenbach et de Schuttern. | 1440-1675 | C 128 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Intendance d'Alsace. | 1280-1794 | C 134-650 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | recordgrp | Panier |
| Affaires féodales. | 1267-1790 | C 264-324 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-fonds | Panier |
| Titres produits par les familles nobles devant la Commission royale des fiefs. | 1267-1790 | C 264-315 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Fiefs des familles dont le nom commence par la lettre Z et reliquat de titres féodaux. | 1351-1756 | C 316-317 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Série organique | Panier |
| Fabrique de Bofzheim, seigneurie de Ronsperg (Bohême), seigneurie de L'Isle-sur-le-Doubs (Franche-Comté), rentes à Eguisheim, fief de la famille Haffner, seigneurie de Bollwiller (Haut-Rhin), fief de la famille Zorn de Plobsheim. | 1351-1756 | C 316 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fief de la famille Zundt, fief de la famille Zuckmantel, droits du marquis de Rosen sur la seigneurie de Herrenstein, demande de la famille de Rathsamhausen de demeurer en Bavière, demande du sieur Marx, bailli de Bergzabern, d'obtenir des lettres de noblesse. | 1474-1748 | C 317 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fiefs de la famille d'Andlau. | 1321-1760 | C 265-266 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-série organique | Panier |
| Titres des fiefs de la famille d'Andlau produits entre 1321 et 1600. | 1321-1600 | C 265 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fiefs du Saint-Empire tenus par l'abbaye d'Andlau et inféodés à titre d'arrières-fiefs à la famille d'Andlau. | 1437-1758 | C 267 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fiefs de la famille de Berckheim. | 1316-1763 | C 269 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fiefs de la famille de Berstett. | 1462-1660 | C 270 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fief de la famille Bock de Blaesheim. | 1412-1680 | C 271 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fief de la famille Boecklin de Boecklinsau. | 1327-1763 | C 273 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fiefs de la famille de Bodeck, fief des familles Breuel et Tanner, fief dit "de Brunstadt" et fief de la famille de Burnkirch. | 1471-1758 | C 274 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fief de la famille de Dürckheim. | 1359-1762 | C 275 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fiefs de la famille de Dietrich. | 1421-1757 | C 276 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fiefs de la famille de Gail et fiefs de la famille de Gottesheim. | 1338-1761 | C 278 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fiefs de la famille de Hesse-Darmstadt. | 1293-1759 | C 282-284 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Sous-série organique | Panier |
| Fiefs tenus par le prince de Hesse-Darmstadt en Alsace en sa qualité de comte de Hanau-Lichtenberg. | 1293-1756 | C 282 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |
| Fief de la famille de Hesse-Darmstadt provenant de l'évêché de Metz. | 1335-1759 | C 283 | Rattachement à l’état des fonds des Archives | Dossier (liasse) | Panier |